Sneek ontwikkelde. Gen. Prov. Kerkbestuur deed den 13den Juni d.a.v. uitspraak (in extenso gepubliceerd in de Kerk. Crt. van 29 Juni 1889), waarbij het de tegen Dr. L.'s Evangeliebediening ingebrachte bezwaren ongegrond verklaarde. Hiermede was de zaak beslist behoudens de vereischte approbatie door het Classicaal Bestuur van Dordrecht. Dit Bestuur echter besloot in een buitengewone vergadering den 15en Juli de approbatie niet te verleenen en den kerkeraad van Sliedrecht uit te noodigen het beroepingswerk onverwijld te hervatten (Gel. en Vrijh. 23e Jrg. (1889), blz. 415, 416, waar dit besluit is afgedrukt). Ter laatste instantie werd de zaak ter behandeling overgegeven aan het Prov. Kerkbestuur van Zuid-Holland, dat aan zijn Moderamen de approbatie opdroeg, aan welk mandaat den 31en Dec. 1889 gevolg werd gegeven. Een laatste poging om deze uitspraak door de Synodale Commissie te doen vernietigen, was als onwettig afgewezen. Den 23en Maart 1890 had de sterk vertraagde bevestiging van Dr. Lieftinck te Sliedrecht plaats. Zij geschiedde door Dr. M. Niemeyer, pred. te Sneek (m. 2 Cor. IV:13c), waarna Dr. Lieftinck zijn intreerede hield (t. Joh. VI:68; afsch. te Rauwerd 9 Maart m. Openb. II:10b). Elf jaren lang bleef hij werkzaam te Sliedrecht tot aan zijn overlijden den 23en Maart 1901.
In zijn brochure Waarom modern? (1885) zet Lieftinck uiteen, hoe hijzelf ertoe gekomen was de rechtzinnige leer, waaraan hij in zijn jonge jaren had vastgehouden, te laten varen, en een overtuigd aanhanger van de moderne richting te worden. Voor deze richting betoonde hij zich als predikant een warm kampioen. Menig populair geschrift van zijn hand vond zijn weg in de gezinnen. Als lid der ‘Commissie voor Godsdienstonderwijs’ was hij belast met de regeling van de colportage der geschriften. Hij was een man, die rond, klaar en krachtig voor zijn meening uitkwam en blijk gaf van een practischen blik. Zijn verscheiden op 54-jarigen leeftijd werd in de kringen zijner geestverwanten door velen betreurd.
Hij huwde te Sneek den 17en Juli 1878 met Froukje Bouwes Stienstra, geb. ald. 26 Dec. 1853, overl. te Sliedrecht 25 Jan. 1901. Uit dit huwelijk zijn geboren één zoon en één dochter.
Van Dr. J.W. Lieftinck Jr. zag behalve zijn bovengen. acad. proefschrift het licht: Het Christendom en onze moderne samenleving. In: Volksbibliotheek. Uitg. van wege de ‘Vereen. t. handhaving en voortplanting v.h. liberale beginsel’. N. Uitg., Amst. 1883. 6e Achttal. no. 2. - Een gedenkwaardige sterfdag (10 Juli 1584). Het leven en sterven van Prins Willem I na drie eeuwen herdacht. Sneek. 1884. 8o (Cat. Letterk. II, k. 120). - Toegetreden. Een vriendenwoord aan nieuwe leden der gemeente. Sneek. 1885. 8o; 7e dr. 1890. 8o. - Waarom modern? Uitg. d. de Vereen. t. verspr. v. stichtelijke blaadjes. Amst. 1885. 8o. - W. Sonntag, De godsdienst in het dagelijksch leven. Uit het Hoogd. Arnh. 1886. 8o. - Voor iederen dag. Godsd. Volksboek. Tiel 1889. 8o; 2e dr. ald. 1890. 8o - [Met Dr. M. Niemeyer]. Geloofsgetuigenis. Een bevest.- en intreerede geh. te Sliedrecht den 23 Maart 1890. Sliedr. 1890. 8o. - [Met E. Laurillard H.P. Schim v.d. Loeff e.a.]. Lichtstralen. Leid. 1890. 8o - Aan een mijlpaal. Toespr. t. herinn. aan zijne 25-jar. ambtsbed. geh. den 6en Oct. 1895. Sliedr. 1895. 8o. - Godsdienstig Dagboekje, Woorden uit den Bijbel voor 1896 en 1897. M. bijschr. Schoonh. 1895. 96. 32o.
Met Dr. W.C. Manen voerde hij de redactie van: Onze Godsdienstprediking. Tiel en Amst. 1875; van 1891 af alleen.
Litteratuur: Hs. Borger, i.v. - De Hervorming. 30 Mrt. 1901. - Gel. en Vrijh.