Indiculus et Chronicon Sanctorum Belgic., cum Calendario Belgico.
Calendarium Ecclesiasticum Antv. Plant. 1574, 12o.
De Canonicis libri tres. Lovan. 1587, 4o.
Natales Sanctorum Belgii; a morte editi Petri Louwii curâ, e Molani scedis cum Chronici Sanctorum Belgii recapitulatione. Ibid. 1595. Duaci. 1616, 8o., met een Supplement van Arnold de Raisse. Ibid. 1626.
Diarium de medicis sanctis. Ibid. 1595, 8o.
Cum Praef. Henr. Cuyckii de Molani vita.
Militia sacra Ducum ac Principum Brabantiae cum Notis Petri Louwii, typis Plant. 1592, 8o.
De historia Sacrarum imaginum et picturarum, pro vero earam usu contra abusus. Lib. IV. Lov. 1570, 1594, 8o.
Driemaal werd dit belangrijk werk in den loop der XVIe eeuw te Antwerpen herdrukt, en in 1771 gaf Paquot er te Luik een nieuwe uitgaaf van in 4o. met vele aanteekeningen en supplementen. Vooral verdient het gedeelte de aandacht, dat handelt over de dwalingen van kunstenaars in het voorstellen van heilige zaken. Het gaf den abt Mery aanleiding tot het schrijven der Theologie de peintres, Sculpteurs et Dessinateurs. Emile Nève schreef: Des travaux de J. Molanus sur l'iconographie Chrètienne. Louv. 1850.
De Canonicis libri III. - De fide haereticis servandâ, libri IIII. - De fide rebellitus servandâ, lib. I. - De fide et iuramento, quae a tyranno exiguntur. Colon. 1585, 8o.
De piis Testamentis et quacumque piae voluntatis dispositione. Colon. 1584, 8o.
Orationes de Agnis Dei.
De decimis dandis et de decimie recipiendis. Colon. 1587, 8o.
Theologiae practieae compendium. Ibid. 1585, 1590, 8o.
Bibliotheca Theologica. Colon. 1618, 4o. P.I.
Deel II is niet gedrukt.
Hij arbeidde ook aan een uitgaaf der werken van Prosperus (Antv. 1574), en van Augustinus (Antv. 1577). Men schrijft hem ook, doch ten onregte, een historisch gedicht Antverpua L.B. 1615, door Joh. Molanus te Bremen (niet te Breda, zoo als de steller van het artikel Molanus in Nouv. Biogr. génér. wil) vervaardigd toe.
Zie Val. Andreas, Farti Acad. Lovan. en Bibl. Belg. p. 539 seqq.; Foppens, Bibl. Belg. T. II. p. 70; H. Cuyckii, Elogium voor het Diar. Med.; C. Loos, Illustr. Germ. Script. Catal.; Miraei, Elog. Belg.; Sweertii, Ath. Belg.; Sanderus, Script. Flandriae; A. Teissier, Eloges des hommes ill. T. II. p. 49 suiv.; Niceron, Mém. P. XXVII; Biogr. Univ.; Dict. Univ.; Nouv. Biogr. génér.; Jöcher; Rotermund; Kobus en de Rivecourt.