Hij overleed den 23 Augustus 1812. Waardenburg was een gelukkig beoefenaar der Latijnsche poëzij, waarvan hij vele proeven heeft gegeven. Ook beoefende hij de moderne talen, toon- en schilderkunst. Hij huwde 1 Catharina Deketh, dochter van den secretaris Govert Deketh en Catharina Hanekrooth, die in het kraambed van haar zoon Everard overleed, 2 Maria Elisabeth Christina Frederika Johanna Starosky, dochter van den ontvanger Gottfried Starosky en Anna Elizabeth Starcke, die hem met zijne 7 kinderen overleefde.
Van hem bestaan:
Carmina Eligiaca. Franekerie 1792.
Opuscula oratoria poëtica critica. Harlemi 1812.
Zijne aanteekeningen op Propertius, waaraan hij zijn gansche leven gewijd heeft, zijn onvoltooid gebleven. ‘Waardenburg’, schreef prof. Peerlkamp, ‘verstond Propertius zoo dat hij daarin door niemand overtroffen werd.
Zie Peerlkamp, de Poët. Latin. Neerl., p. 254; Hoeufft, Parn. Lit. Belg., p. 251; Wyttenbach, Philom., III. p. 275; G.H. de Friese, Memoria, H.G. Waardenburg, p. 7; K. en L. bode 5 Oct. 1813; Levensberigt van H. Waardenburg in Vruchten ingezameld door de aloude Rederijkkamer de Wijngaardranken, Haarlem 1833 met lofdichten van Loosjes, Peerlkamp en andd.; Verwoert; Kobus en de Rivecourt; v.d. Aa, N.B.A.C. Wb.